Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms