Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms