Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEX3Q00994 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms