Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms