Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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