Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRX1P78414 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRX1P78414 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRX1P78414 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms