Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX1P78337 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX1P78337 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX1P78337 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX1P78337 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX1P78337 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX1P78337 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX1P78337 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX1P78337 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms