Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-24P63145 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms