Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA2P62736 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms