Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VBP1P61758 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms