Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABP4P57796 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABP4P57796 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CABP4P57796 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CABP4P57796 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CABP4P57796 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CABP4P57796 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABP4P57796 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms