Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BACE1P56817 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BACE1P56817 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BACE1P56817 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BACE1P56817 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BACE1P56817 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BACE1P56817 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms