Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms