Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PGGT1BP53609 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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