Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUCLG1P53597 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms