Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RORCP51449 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RORCP51449 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RORCP51449 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RORCP51449 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RORCP51449 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RORCP51449 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RORCP51449 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms