Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms