Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX5P48382 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX5P48382 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX5P48382 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX5P48382 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms