Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms