Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms