Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5CP41229 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms