Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCA1P38398 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA1P38398 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms