Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB1P37275 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms