Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms