Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT4P35916 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT4P35916 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT4P35916 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLT4P35916 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms