Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms