Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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