Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms