Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms