Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HRCP23327 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HRCP23327 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HRCP23327 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HRCP23327 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HRCP23327 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HRCP23327 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HRCP23327 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HRCP23327 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HRCP23327 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
HRCP23327 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
HRCP23327 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HRCP23327 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HRCP23327 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HRCP23327 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HRCP23327 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HRCP23327 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HRCP23327 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HRCP23327 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HRCP23327 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HRCP23327 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HRCP23327 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HRCP23327 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms