Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms