Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRB1P18505 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB1P18505 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms