Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCLP18206 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCLP18206 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VCLP18206 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms