Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XBP1P17861 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XBP1P17861 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XBP1P17861 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XBP1P17861 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms