Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms