Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms