Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms