Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG2P13521 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG2P13521 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG2P13521 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG2P13521 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG2P13521 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG2P13521 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG2P13521 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms