Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms