Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODC1P11926 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms