Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI3P10071 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI3P10071 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI3P10071 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI3P10071 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI3P10071 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI3P10071 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI3P10071 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms