Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms