Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NGFRP08138 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms