Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSF2P04141 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSF2P04141 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSF2P04141 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSF2P04141 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSF2P04141 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms