Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5O75197 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5O75197 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5O75197 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5O75197 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5O75197 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP5O75197 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP5O75197 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP5O75197 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP5O75197 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP5O75197 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP5O75197 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP5O75197 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP5O75197 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP5O75197 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5O75197 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5O75197 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms