Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms