Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTRA2O43464 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms