Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIAH2O43255 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms