Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGFO15240 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VGFO15240 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VGFO15240 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VGFO15240 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VGFO15240 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VGFO15240 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VGFO15240 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VGFO15240 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VGFO15240 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGFO15240 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGFO15240 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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