Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBDO15205 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms